ntc的扩增曲线像条直线平得很,才能放心把样本数据写到论文里去

2005年开始运营的天罗诊断集团,到了2018年就把重点放在了做IVD上游酶原料上。他们手里有一件秘密武器叫“5G聚合酶”,具备高速度、高灵敏和抗抑制的优点,不管是测非洲猪瘟还是新冠,都能让检测曲线跑得又快又稳。集团子公司拿了中科院“品质最佳供应商”、上海“最具投资潜力50佳”等奖项,行业报告也把他们列为了分子诊断酶原料特色企业。 这次“NTC挑战”是军事医学科学院组织的,他们把仪器和循环参数都固定死了,只换定量PCR的Master Mix。一共用了三款试剂来PK:TOROGreen qPCR Master Mix(QST-100)、TOROGreen HRM qPCR Master Mix(QET-100),还有一款是某Z品牌。三管试剂一起加到同一台仪器上跑实验,然后看谁的NTC更干净更稳。 NTC(NO TEMPLATE CONTROL)也就是无模板阴性对照,它的工作就是充当实验前的守门员,专门负责揪出污染和引物二聚体这两个隐形杀手。只要NTC的扩增曲线像条直线平得很,才能放心把样本数据写到论文里去。 我们先来看结果图,横轴放的是试剂品牌,纵轴是Ct值,蓝色柱子越矮说明二聚体信号越低。从图上看,QST-100和Z品牌在两对引物上都没出现明显的峰抬升,说明引物二聚体被压制住了;QET-100也很干净,不过因为配方侧重HRM,所以SYBR定量这块就不太强推。如果客户自己的引物设计本来就有问题,那也没辙了,再好的试剂也救不了。 二聚体的Ct值要是低了,定量结果的可信度立马就掉下来;轻则数据飘来飘去不准,重则直接变成假阳性或者假阴性。所以选试剂的第一规矩是:先把NTC弄干净了,再去谈别的性能。 我们总结一下选靠谱试剂的方法:第一步先跑NTC看能不能出平线;第二步看同样一对引物、同样一套体系下的Ct值越低越好;第三步兼顾实际检测场景是要HRM还是绝对定量?是要荧光曲线还是熔解曲线?把这些步骤做成实验SOP流程以后,试剂里有啥坑位一眼就能看出来了,既提高科研效率又保证数据的可信度。