1899年9月，32岁的章太炎从日本回到上海，再给家乡杭州转移。两年里他被通缉过两次，虽然不是官方定义的，但也给他的生活带来了不少困扰。于是他就开始在上海、杭州、台北和日本多地漂泊。在杭州的时候，章太炎本来打算干一番大事业，还和几位志趣相投的人创立了“兴浙会”。为了让大家学习江浙地区的英才，他给大家介绍了几个杰出人物。这些人包括为推翻蒙元统治立下赫赫功劳的刘基、抗击蒙古入侵让敌人胆寒的于谦、“学与政兼之”的大学者王阳明、黄宗羲和张煌言。可是大家一听这些人物的事迹，都有些退缩了，“兴浙会”也变成了没什么灵魂的“兴浙学会”。章太炎因此感到非常失落。不过，这两年在外闯荡让他思想更加成熟，感觉又可以干一番大事业了。他把自荐信给李鸿章和刘坤一写过去，劝说他们自立或者自保，不要再为满人卖命。可惜他的一些主张与李鸿章思想相反，没有被采纳。随后他还参加了“中国议会”，但也没有什么结果。总之，这个时候章太炎一直在寻找适合自己的路。1900年8月3日，这个酒鬼章疯子又喝醉了酒，心血来潮地拿剪刀剪掉了跟随自己三十三年的辫子。这个举动在当时非常激进，因为那时候头发身体发肤受之父母，不能随意处置。剪掉辫子后不久，章太炎也换上了西装。这件事情让他发表了《解辫发说》，号召更多仁人志士加入他的行列。之前章炳麟在报纸上发表《谢本师》断绝师生关系。因为他师从名士俞樾，学成后却和恩师断绝关系引起了广泛讨论。后来我们知道是为了保护恩师俞樾才这么做的。1900年8月章太炎剪掉辫子后又离开了杭州这个高风险职业的地方。他的家族人员对外宣布开除他的祖籍：“章炳麟无视大清王法，割辫易服，既犯王法又违家规罪不可恕故特此声明：将章炳麟开除出族！他一人做事一人当今后他在外面有什么大祸概与章氏亲族无涉。”这次关于章炳麟是否真的被开除祖籍还是假意为之还是有争论的。有些人觉得是真的被开除了祖籍；另一些人则认为章炳麟和大哥商量为了保护家族自愿被开除祖籍。总之这件事情是真实发生过的。从此章炳麟再也没有羁绊了，可以天高任鸟飞海阔凭鱼跃。